L'Equipe "Biocatalyse et Métabolisme" est issue du regroupement des équipes "Bioconversion et synthèse chimioenzymatique" et "RMN métabolique et environnement". En effet, les activités de ces deux équipes sont centrées sur l'étude et l'utilisation d'enzymes quelles soient purifiées ou organisées en réseaux métaboliques. Nos compétences se situent à l'interface chimie/biologie : synthèse organique, chimie analytique, microbiologie. Deux thématiques sont développées au sein de cette équipe :
- Biocatalyse en synthèse organique pour la préparation de molécules organiques d'intérêt biologique
- Métabolisme et environnement pour la compréhension du métabolisme de microorganismes lors de la dégradation de substrats.
De plus au-delà de l'approche fondamentale, nos recherches visent à développer des projets valorisables dans le domaine des biotechnologies, de la santé et de l'environnement.
1- Sous-thématique "Biocatalyse en synthèse organique"
Responsable : L. Hecquet
Nos objectifs visent à préparer des molécules organiques biologiquement actives en utilisant des stratégies de synthèse originales faisant intervenir des biocatalyseurs pour une meilleure efficacité, à optimiser les enzymes utilisées notamment par mutagenèse et aussi à rechercher de nouvelles activités enzymatiques en exploitant la biodiversité des microorganismes.
Dans le cadre du prochain contrat quadriennal, nous souhaitons poursuivre nos travaux dans les trois thèmes suivants :
- Applications des aminotransférases à la production d'acides aminés non protéinogéniques - Synthèse d'analogues de l'acide glutamique
- Applications de la fructose-bisphosphate aldolase et de la transcétolase à la synthèse de sucres rares et analogues
- Ingénierie de la transcetolase
- Recherche de nouvelles activités enzymatiques
Nous envisageons d'orienter nos travaux vers la recherche de nouvelles activités en exploitant la biodiversité des microorganismes présents dans nos collections mais aussi en recherchant d'autres sources d'enzymes.
2- Sous-thématique"Métabolisme et environnement"
Responsable : P. Besse-Hoggan
Pour les années à venir, nous allons resserrer nos thématiques de recherche autour de seulement trois thèmes, totalement centrés sur les problèmes d'environnement et en adéquation avec la politique locale (PREVOIR, Projet Métabolisme), nationale (Réseau Metabolomique et fluxomique, PNCA du CNRS) et internationale (INTAS…). Dans ce cadre, nous abandonnerons le thème lié à la dégradation des fibres végétales par F. succinogenes.
Pour les sujets traités, qu'ils concernent les milieux sols, eau ou atmosphère, non seulement nous continuerons à étudier le métabolisme de xénobiotiques et la modulation de ce métabolisme par des facteurs environnementaux (matrices de sols, Fer, lumière, température, pH…etc) mais ce qui sera nouveau, c'est que nous essaierons en parallèle d'étudier de plus près le métabolisme "intrinsèque" des cellules, soit par RMN in vivo soit par une approche de métabolomique. Ainsi nous essaierons de coupler métabolisme de xénobiotique et métabolisme central.
